Nytt instrument gör analyser på arvsmassan billigare och snabbare

– Med det nya instrumentet kommer vi kunna genomföra fler projekt från forskare på Örebro universitet och inom Region Örebro län som har kliniska projekt där man vill undersöka genomiken - hela vår arvsmassa, säger Bianca Stenmark, Head of Facility för Clinical Genomics Örebro.

Instrumentet lämpar sig speciellt där forskaren vill använda sig av större genpaneler eller exomsekvensering vilket innebär att man studerar den proteinkodande delen av arvsmassan.

Nya möjligheter inom klinisk forskning

– Exomsekvensering används främst för att studera ärftliga sjukdomar och komplexa sjukdomar, alltså sjukdomar som orsakas av förändringar i flera gener, såsom diabetes, psykiatriska och reumatiska sjukdomar, berättar hon.

Det nya instrumentet liknar den utrustning som funnits på enheten sedan 2013 då sekvensering började användas.

– Första gången vi började sekvensera studerade vi främst arvsmassan hos bakterier, som är väldigt liten i förhållande till människans, för smittspårning. Det nya instrumentet har fördelen jämfört mot våra andra instrument att den kan sekvensera mycket fler prover samtidigt, den kan sekvensera ett helt humant genom och kostnaden halveras.

Bianca ser möjligheter både inom den kliniska forskningen men också den kliniska diagnostiken i framtiden, exempelvis för att slippa odla bakterier och svampar. I dagsläget tar det några dagar för långsamt växande mikroorganismer.

– Vi hoppas att vårt nya instrument ska vara till hjälp för våra forskare att utveckla morgondagens teknik, till exempel kunna diagnosticera infektionssjukdomar snabbare genom att ta reda på alla olika mikroorganismer som finns i provet via deras arvsmassa med hjälp av denna typ av teknik.

Den nya tekniken sekvenserar arvsmassan oavsett om det är ett djur, en bakterie, svamp eller virus.